巢湖市档案馆成立于1959年，是集中保管全市机关、团体、企事业单位、乡镇街道档案资料的国家综合档案馆，也是合肥市、巢湖市爱国主义教育基地，巢湖市政府信息公开查询场所。1998年晋升为安徽省一级档案馆，2003年又重新认定为安徽省一级档案馆，2008年晋升为国家二级档案馆。“十一五”“十二五”连续获得安徽省档案系统先进集体称号。

  主要负责接收市直各单位和其他组织按规定移交进馆的档案资料，征集散存在社会上的珍贵档案资料，保护档案的完整与安全，对馆藏档案进行科学整理、编目、鉴定、数字化、技术保护，加强档案资料编研和开发利用、档案文化建设和档案展览展示工作。现内设办公室、保管利用科、征集编研科、技术科四个科室，下属事业单位巢湖市电子文件管理中心。

  巢湖市档案馆面积为10000平米，规划设计为乙级馆。内设档案调阅场所、爱国主义教育基地、档案库房、消毒房、技术用房和办公用房。功能齐全,造型美观,是巢湖市的标志性建筑。

  现有馆藏档案资料近65万卷（件）。馆藏档案资料主要是革命历史档案、民国档案和建国以后的档案，建国后的档案门类有文书档案、会计档案、科技档案、人事档案、电子档案、声像档案等，共有155个全宗。馆藏档案以纸质档案和电子档案为主，另外包括录音、录像、照片、实物等档案。